A történelmi helyszín, ahol a vár található már a 9. században lakott terület volt, az első írásos említés 871- ből származik. Egy régi morva település helyére épült. A várnak eredetileg a Nyitra folyó biztosított természetes védelmet mely félkörben övezte a sziklát, melyre épült. A Nagy-Morva (Veľká Morava) birodalom idején Szvatopluk morva fejedelem tartózkodási helye, valamint ebben az időszakban, 880-892 között püspöki székhely volt. A vár 1241-ben ellenállt a tatárjárásnak, de később egy része tűzvészben megsérült, majd a 14. században Csák Máté hódították meg. 1663-ban a vár és a város is török uralom alá került, ami óriási károkat okozott, melyeket a törökök kivonulása után alig egy évvel kezdtek kijavítani. A vár jelenlegi megjelenését és alakját a 17. században kapta, bár a Rákóczi felkelés ideje alatt ismét megsérült. A háborús idők elmúltával elveszítette katonai fontosságát. A vár legfontosabb történelmi és művészeti remekműve a Szent Emeram püspöki székesegyház, mely a 11. században épült és a turisták számára is elérhető. Jelenleg a nyitrai püspök, valamint a Szlovák Tudományos Akadémia Régészeti Intézetének székhelye.